في سبيل النهوض برسالتها على أكمل وجه ، وفي إطار عملية التحديث والرقمنة والتطوير المؤسسي أصدر معالي أ.د/ محمد مختار جمعة وزير الأوقاف القرار التنفيذي رقم (251) بتاريخ 19/ 12/ 2020م لقرار السيد رئيس الجهاز المركزي للتنظيم والإدارة رقم (282) بتاريخ 16/ 12/ 2020م بشأن اعتماد الهيكل الإداري والتنظيمي الجديد للوزارة.
ويتميز الهيكل الجديد بالاعتماد الكبير على الرقمنة والميكنة والتطوير المؤسسي المستمر ، والعناية الفائقة بالعنصر البشري ، واختصار الإجراءات الإدارية بما يضمن دقة العمل وسرعة تنفيذه معًا ، والاعتماد على طرق التقييم الحديثة والذكية ، وسيتم اتخاذ الإجراءات التنفيذية لهذا الهيكل بدءًا من الأحد المقبل الموافق 20 / 12 / 2020م .