فى إطار حرص القيادة العامة للقوات المسلحة على تبادل الخبرات العلمية بين القوات المسلحة والجامعات المصرية وتحقيق أقصى درجات التعاون المثمر فى مجالات البحث العلمى وتقديم الخدمات الطبية والتعليم الطبى المتميز ، وقعت كلية الطب بالقوات المسلحة بروتوكول تعاون مع كلية الطب بجامعة القاهرة فى مجالات التعليم والتدريب للطلاب والأطباء فى التخصصات الطبية المختلفة وكذا الأنشطة العلاجية والبحثية .
ويهدف البروتوكول إلى تنفيذ برامج أكاديمية وتعليمية وتوفير فرص تدريب متميزة لطلاب كلا الكليتين مما يسهم فى تخريج أجيال متميزة من شباب الأطباء قادرين على تلبية الإحتياجات الطبية للمجتمع ، كما تم الإتفاق على تنظيم دورات تدريبية وعقد ورش العمل التخصصية فى الموضوعات ذات الإهتمام المشترك لصقل مهارات الطلاب والأطباء حديثى التخرج وطلاب الدراسات العليا ، وكذلك التنسيق والإستفادة المشتركة من خبرات الطرفين فى برامج التدريب للأطباء الخريجين وأطباء الإمتياز ، والإشراف المتبادل على رسائل الماجستير والدكتوراة .
يأتي ذلك إنطلاقاً من دور القوات المسلحة فى تهيئة فرص أكبر للتعاون مع المؤسسات البحثية وكليات الطب بالجامعات المصرية للإرتقاء بمستوى المنظومة الصحية فى مصر بما ينعكس آثاره على تقديم خدمة طبية فائقة للمجتمع المصرى .